Données Covid-19

L’émergence et la rapidité de propagation du SARS-CoV-2 ont révélé le problème de collecte et de partage de données, essentielles pour l’analyse et la compréhension de l’évolution et de l’impact du virus à travers le monde. Cette équipe d’ingénieurs a permis le développement d'une cartographie dynamique des essais cliniques liés à la pandémie du Covid-19.

Au début de la crise sanitaire, le Centre de recherche en épidémiologie et statistiques (CRESS) a sollicité le CNRS pour aider à la constitution d’une cartographie de toutes les études cliniques évaluant les méthodes de traitement et de prévention du Covid-19. Les données relatives aux essais cliniques sont disponibles dans des registres hétérogènes parfois peu accessibles. La récupération des données manquantes nécessitait des opérations manuelles laborieuses. En moins de 2 mois en 2020, la collaboration « Données Covid-19 » a permis d'automatiser le traitement de ces nombreuses études dans un entrepôt de données. Structurées et enrichies par les experts du CRESS, elles sont accessibles à tous, professionnels de santé et décideurs. Les données peuvent alors être extraites et exploitées par une analyse automatique du langage permettant de dégager les concepts clefs. Ces concepts sont ensuite mis en relation dans des graphes à la fois statiques et dynamiques dans le temps pour construire et questionner des modèles de systèmes complexes grâce à l’initiative Covprehension7 . Sur une période courte et en phase de confinement strict, ce collectif issu de 7 structures de recherche différentes et en collaboration avec des chercheurs, a su capitaliser sur des expertises complémentaires pour contribuer à l’élaboration de solutions opérationnelles. Son travail se poursuit depuis, avec aujourd'hui des solutions généralisables à d’autres domaines du secteur de la santé.

• 7 Covprehension: https://covprehension.org/